定作出巨大让步。
他认为，四川人民受苦太深，不能再发生内乱了。
成渝必须迅速合并，以实现全川的统一。
他高风亮节地发表《成渝两军政府合并后政见书》，表示推荐尹昌衡任正都督，自己愿意屈就副都督职务。
经过艰苦的谈判，双方达成了两个军政府合并的条件。
然后双方代表立即赴渝，签订《成都四川军政府、重庆蜀军政府协议合并草约》。
协议草约确定以成都为四川省会，设立中华民国四川军政府，另外在重庆设立军政府下属的镇抚府。
尹昌衡出任新政府都督，张培爵任副都督，夏之时任重庆镇抚府总长。
重庆蜀军改编为川军第五师，熊克武任师长兼重庆镇守使。
协议经双方军政府盖章批准生效，并通告全国，成渝实现顺利合并，南京政府立即给予承认。
成渝原先的两个军政府同时撤销，归属到中华民国四川军政府，四川全省终于实现了统一。
可是四川统一后，重庆军政府虽然并入了成都，但是尹昌衡对革命党人云集的重庆并不放心。
特别是重庆设立的镇抚府，组织体系庞大，人心不稳。
尹昌衡十分担心，弄不好随时可能演变成第二个独立的都督府。
于是，他派人去重庆进行威逼利诱，游说年轻的夏之时出国去留学，并答应赠送三万元学费。
夏之时向尹昌衡发电，同意辞去镇抚府总长职务，即时出洋去留学。
尹昌衡为了加强自己的势力，决定将全川的军权托付给小诸葛胡景伊。
他还通电全国，吹嘘胡景伊：
“学时优长，心精力果，经验宏深。方其志勇，直轶先贤，凡我干城，皆属后进。允宜特任全川陆军军团长，兼军事参议院副院长，各镇均受节制。”
重庆镇抚府本是蜀军政府在成渝合并时争来的，是同盟会员坚守的一个战略据点。
尹昌衡为了削弱同盟会的力量，趁夏之时辞职出国留学的机会，立即任命胡景伊兼任重庆镇抚府总长职务。
他想利用这个“诸葛军师”的谋略，来镇住当地的革命党人，稳定四川的半壁江山。
胡景伊星夜兼程赶去重庆赴任，但他担心重庆方面不服，便调来一个机枪营护送。
重庆的革命党人虽然恨死了胡景伊，但为了顾全大局，只能接受洋洋得意的胡景伊来上任。
可是，令尹昌衡做梦也没有想到的是，胡景伊竟然背着自己，与早就看不惯尹同学的周骏勾搭在一起，投靠了窃取民国总统职务的袁世凯。
胡景伊与袁世凯密谋，要将尹昌衡挤出四川，以便夺取四川都督宝座。
不久，西藏的叛国分子在外国唆使下，派兵攻入川境，巴塘和里塘相继失守。
叛军进至打箭炉时，全川震动。
袁世凯趁机任命尹昌衡为征西军总司令，带领川军去平叛
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